除了从技术上提高试管婴儿的成功率，第三代试管婴儿还能在胚胎移植前检测出绝大多数基因病和先天性疾病，因此，自第三代试管婴儿问世以来，其畸形概率和先天性不足的可能性大大降低。
避免染色体异常问题：第三代试管婴儿通过PGD/PGS技术对胚胎进行基因筛查，接着筛选出染色体异常的胚胎，避免染色体问题引起的流产风险。
提高移植成功率：第一代试管婴儿通过促排卵取出女性卵子，同时取出男性精液，在实验室环境下让其自然结合，不采取干预措施。这一代采用精卵自然结合的方式，成功率相对比较低。第二代试管婴儿将单个精子注射到卵细胞包浆中，令精子和卵细胞形成受精卵。这一代精卵结合的成功率很高，但不能检测胚胎的遗传基因。第三代试管婴儿可以在第二代试管婴儿的基础上，进行遗传基因的检查。
降低胎停率：在胚胎移植前，通过PGD/PGS技术对胚胎进行筛查，选择健康胚胎进行移植，在移植后期出现胎停的情况会低于未被筛查的胚胎。可以最大限度地减少后续胎儿停止发育的情况 。
性别区分：通过PGS技术，可以知道胚胎性别，让患有单基因遗传病的夫妻可以选择胎儿性别，避免后期出现胎儿健康问题；如果身体情况允许，准妈咪们还能选择移植两个胚胎。
规避遗传性疾病：如果夫妻双方一方携带有遗传性疾病，或者女方因高龄而出现不良孕产史，都将对下一代造成影响，而借助第三代试管婴儿技术单细胞DNA分析法，可检测单基因遗传病和染色体疾病。剔除有遗传病的胚胎，移植健康的胚胎，大幅度降低胎儿的健康风险，确保后续新生婴儿的身体健康。
第三代试管婴儿的弊
医院数量少：目前国内医院仍普遍采用二代试管婴儿技术，而且符合开展第三代试管婴儿技术的医院相对较少，同时，我国对于做第三代试管婴儿技术的要求很严格，无法保证国内巨大的生育需求。
费用高：相比于第一代、第二代试管婴儿的费用，第三代试管婴儿运用PGD和PGS技术检测胚胎，相应地就增加了整个周期的费用。
第三代试管婴儿技术有利也有弊，总体来说还是利大于弊，所以不孕不育家庭在决定是否要做试管婴儿时，可以根据自己的实际情况，结合医生的建议综合考虑，选择最适合自身情况的方法，从而完成生育愿望。
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